มหาวิทยาลัยอิสลาม อัลฟาฏอนี ได้เป็นเจ้าภาพการจัดประชุมคณะกรรมการจัดการประชุมวิชาการระดับชาติ ขึ้นในวันที่ 29 พฤษภาคม 2557 โดยมีผู้เข้าร่วมประชุม ประกอบไปด้วย มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา มหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์ ซึ่งได้มีการหารือเกี่ยวกับรูปแบบในการจัดงาน ไม่ว่าจะเป็นพิธีการ หัวข้อการบรรยาย ปาฐกถา แบบฟอร์มการให้คะแนนการนำเสนอภาคบรรยายดีเด่นและภาคโปสเตอร์ ดีเด่น เป็นต้น